مات الحجاج بن يوسف الثقفي نتيجة مرض غريب يعرف بالأكلة، حيث وقعت في بطنه ديدان (يرقات ذباب) تنخر أحشائه، مما تسبب في عذاب شديد له. استمر هذا العذاب لمدة 15 يوماً، إذ كان يشعر بحرارة نار في جوفه وببرد شديد على جلده (الزمهرير)، وكان يُوقد له النار ليدفئ نفسه وهو لا يشعر بحرارتها بسبب المرض. في أواخر حياته كان مفزوعاً، ويتحدث عن سعيد بن جبير الذي قتله، حتى توفي في شهر رمضان سنة 95 هـ في مدينة واسط ودفن هناك مع إخفاء قبره كي لا ينبشه الناس. كان الحجاج مشهوراً بقسوته وسفك الدماء، وانتقامه من خصومه وبالأخص قتله لسعيد بن جبير الذي دعا عليه بالقتل ثم مات بعدها الحجاج بخمسة عشر يوماً. عانى في نهاية حياته من المرض المؤلم جداً حتى أن الحسن البصري نهره على أفعاله ولكنه لم يطلب من أحد الدعاء له بالشفاء بل طلب أن يسرع الله قبض روحه ولا يطيل عذابه.
