Librus jest płatny tylko w rozszerzonej wersji aplikacji mobilnej, zwanej "Mobilne dodatki" lub "Mobilne dodatki PLUS". Podstawowa wersja e-dziennika dostępna przez stronę internetową jest bezpłatna i umożliwia korzystanie z podstawowych funkcji, takich jak monitorowanie ocen, nieobecności czy planu lekcji. Opłaty dotyczą zatem przede wszystkim dodatkowych funkcji w aplikacji na telefon lub tablet, które mają zwiększyć komfort użytkowania, na przykład powiadomienia, usprawiedliwienia czy aktualizacje ocen na bieżąco. Koszt tych mobilnych dodatków to około 36 do 50 złotych za rok szkolny, a opłata jest pobierana za konto każdego ucznia osobno. Takie rozwiązanie wprowadza firma Librus, mimo że zgodnie z rozporządzeniem Ministerstwa Edukacji Narodowej, koszty dostępu do e-dziennika powinny ponosić samorządy. W praktyce jednak firmy oferujące e-dzienniki wprowadzają opcjonalne płatne rozszerzenia w aplikacjach mobilnych, które rodzice mogą wykupić dla wygody i dodatkowych funkcji. Dostęp do podstawowego dziennika przez przeglądarkę oscyluje nadal wokół modelu darmowego użytkowania, co jest zgodne z prawem i oczekiwaniami użytkowników.