Man får blåsor i munnen ofta på grund av en kombination av lokal irritation och kroppens reaktion på inre obalanser som stress eller vitaminbrist. Vanliga orsaker inkluderar virusinfektioner som herpes simplex, mekaniska skador från exempelvis bitmärken eller vassa matbitar, hormonella förändringar, vitaminbrist (särskilt B12, järn och folsyra), samt vissa autoimmuna sjukdomar och inflammatoriska tillstånd som afte. Blåsor kan också uppstå vid dåligt sittande tandproteser, överansträngning, eller som en reaktion på vissa livsmedel eller tandkräm. Afte är en vanlig inflammatorisk orsak som kan komma och gå, ofta i samband med nedsatt immunförsvar.