Pepparkakans namn hänger troligen samman med kryddorna som användes i receptet i äldre tider, och det finns flera teorier om exakt varför just ordet “pepparkaka” används i svenska sammanhang. En vanlig uppfattning är att namnet kommer från peppar eller att alla exotiska kryddor kallades “peppar” på medeltiden, så att kakan helt enkelt betecknades som en starkkryddad kaka. En annan teori är att kryddorna var så lika i smak och doft att de blandades ihop i folks minnen, vilket ledde till benämningen pepparkaka. Historiska hänvisningar antyder att kryddor som kanel, ingefära, kryddnejlika och ibland peppar användes i pepparkakor, vilket stärkte kopplingen till ordet peppar trots att dagens färdigbakade produkter ofta inte innehåller riktig peppar. Dessutom finns folkliga sägner, såsom att pepparkakor kunde påverka humör eller ha medicinska kopplingar, som har bidragit till myter kring deras namn. Sammanfattningsvis är det namnets ursprung inte helt definit, men de dominerande förklaringarna kretsar kring användningen av peppar/pepparkryddor som beteckning för starka kryddor och deras historiska närvaro i receptet.
