المياه الجوفية ليست دائماً مياه عذبة تخلو من أي نسبة من الأملاح أو المواد الضارة بصحة الإنسان. هذا الاعتقاد خاطئ، لأن المياه الجوفية تحتوي عادةً على أملاح معدنية مثل الكالسيوم، المغنيسيوم، والصوديوم، ونسب هذه الأملاح تختلف بناءً على نوع الصخور التي يمر بها الماء والمنطقة الجغرافية. كما قد تتعرض المياه الجوفية للتلوث الكيميائي أو البشري مثل تسرب المبيدات أو المواد الصناعية، وقد تحتوي أحياناً على عناصر ضارة كالنترات أو المعادن الثقيلة. لذلك، لا يمكن اعتبارها دائماً خالية تماماً من الأملاح أو المواد الضارة، وجود الأملاح قد يكون قليلًا في الكثير من الحالات أو مرتفعًا في مناطق معينة مما يؤثر على صلاحية الماء للشرب. عادةً تُصنف المياه العذبة بأنها تحتوي على نسبة أملاح ذائبة تقل عن 1000 ميليغرام لكل لتر، والمياه التي تحتوي على أقل من 500 ميليغرام تعتبر نقية. مياه الشرب يجب أن تكون ضمن هذه الحدود للحفاظ على صحة الإنسان. لضمان جودة المياه الجوفية يُنصح بإجراء اختبارات دورية وتنقية الماء عند الضرورة.
